A linha de pesquisa em Genômica e Proteômica envolve o estudo da estrutura, função e expressão de genomas, bem como a análise de proteínas em larga escala. Utiliza abordagens modernas de sequenciamento de DNA, análise de expressão gênica e caracterização proteica para compreender sistemas biológicos complexos.
Os projetos nesta área incluem estudos de organismos modelo, plantas, microrganismos e sistemas de interesse biotecnológico, com forte integração com redes nacionais e internacionais de pesquisa.